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1、按照凍干方式劃分。
當樣品量較少的情況下可無需超低溫冰箱預凍，直接將樣品放在冷阱中凍干的方式稱為ProcessA；樣品在冷阱以外預凍后再凍干的方式稱ProcessB。
支持ProcessA凍干的凍干機。此類從樣品的預凍直至凍干整個過程均不需要人工操作的機器稱作原位凍干機。原位凍干機是凍干機發展方向，是進行凍干工藝摸索的理想選擇，特別適用于醫藥、生物制品及其他特殊產品的凍干。上海拓紛機械設備有限公司生產的實驗室型凍干機FD系列均支持冷阱預凍功能，可針對少量樣品實現原位凍干功能。
支持ProcessB凍干的凍干機。凍干腔和冷阱為獨立的上下結構，凍干腔沒有預凍功能，一般可以歸為ProcessB凍干方式。該類型的凍干機在物料預凍結束后轉入干燥過程時需人工操作。大部分實驗型凍干機都為鐘罩型，凍干腔多采用透明有機玻璃罩，便于觀察物料的凍干情況。
2、按照功能選擇
普通擱板型：物料散裝于物料盤中的凍干。
帶壓蓋裝置型：適用于西林瓶凍干方式，凍干準備時，按需要將物料分裝在西林瓶中，浮蓋瓶蓋后進行凍干，干燥結束后操作壓蓋裝置壓緊瓶蓋，即可完成凍干，此操作可避免二次污染、重新吸附水分，易于長期保存。
多歧管型：利用多歧管或者凍干腔燒瓶，對旋凍在瓶內壁的物料進行干燥，這時燒瓶作為容器接在干燥箱外的歧管上，燒瓶中的物料靠室溫加熱，通過多歧管開關裝置，可按需要隨時取下或裝上燒瓶，不需要停機。
帶預凍功能型：物料預凍過程，冷阱作為預凍腔預凍物料，在干燥過程，冷阱為捕水器，捕獲物料溢出的水分。帶預凍功能的凍干機，冷凍干燥過程物料的預凍、干燥等均在凍干機上完成，凍干機使用效率高，節省了低溫冰箱的費用。
擁有近二十年凍干機生產制造經驗的北京博醫康，產品線以實驗、中試機型為主，生產型為輔。旗下FD系列、Lab系列、Pilot系列、LYO系列等多而全的凍干機產品系統，能夠滿足客戶多方面的凍干機產品需求。其凍干機主要特點為：實驗機品種眾多，從簡易型至全功能型，全方面滿足實驗室對凍干機的不同程度需求；中試機針對不同應用領域提出不同解決方案；針對實驗室中試需求有相應的中試臺式機型，針對要求體積小，功能齊全的中試需求有相應的中試小立式機型，針對要求GMP標準中試需求有相應的穿墻中試機型。
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